道場開了以後，來往的人太多。雲谷禪師又移居到後山的幽深處，叫「天開巖」的山裡修行。依然是影隻形孤。在這一階段，許多官員和在家居士，因為陸公的參與。引導，大家都已知道有「禪宗」這回事。又傳聞雲谷禪師風範，所以很多人去參見他。

凡是來參見的人一到，雲谷禪師總是問他們:「你日常做什麼勾當?」不論貧賤富貴僧侶，到他禪房來。一定把「蒲團」擲在地上，叫他們盤膝正坐。

反觀自己「本來面目」，甚至於整天整夜不說一句話，在臨別的時候，一定叮嚀著說:「你不要浪費歲月啊!」等到再見到的時候。一定要問：「分別後努力修道，功夫用的有沒有進步啊!」所以遇一些無心修道的人，便茫茫然無法回答。因為他的慈悲心愈切而嚴責之情更重。

雖然雲谷禪師沒有建立甚麼門派，收徙傳道，但是見到他的人彷彿面對高峰峻崖。有不寒而慄之感。然而。雲谷禪師全都以平等心來攝受、加被他們;他接引參訪他的人，向來都是低聲婉語，平心靜氣，從沒有過嚴厲的責備。

因而讀書人、為官的人。皈依他的也一天天多起來。因此，他不能靜靜地修行，有人想求見他的，他總以接引他們、加被他們為前提也接見了。每年，他從山中到城裡一次，一定寄單在「回光寺」。........回最前

每次到回光寺，在家男女居士，都湧過來，如圍繞著蓮花寶座一樣，而雲谷禪師看到這種受人擁戴的景況，好像看作夢中的花、霧中的月，不起一點分別心，因此，親近他的人，好像嬰兒依傍慈母一般。

雲谷禪師每次出城，大多寄居在普德寺。寺裡的老和尚懼鶴悅公，實在受到他的益處不少，我（憨山大師自稱）的太師翁（即太師祖）每次請他到方丈室裡來求教，常常是十天半個月的。我做小孩時，便親近侍奉他了，承他老人家非常器重我，對我不厭其勞地訓誨開示。

我十九歲那一年，忽然不想出家了，被雲谷禪師知道了，問我說：「你為什麼要違背最初立志出家的心願呢?」我就說:「祇是我厭煩一般出家人太過庸俗了!」

雲谷禪師說：「你既知道厭煩世俗，又為什麼不學一學古代高僧呢？古代的高僧，皇帝不以臣子的地位看待他;父母不以子女的地位教養他；天龍八部對他無限地恭敬，也不認為可喜：你應該找出「傳燈錄」。「高僧傳」這些書讀讀看，就知道了!」........回最前

我（憨山大師自稱）當下就檢查書箱，查出一部「中峰廣錄」的書，捧著去見雲谷禪師，師說：「你熟讀這部書，就知道出家人的高貴之處了!」

我從此時便決心落髮為僧，實在是受到雲谷禪師的啟示，這是嘉靖（一五六四，明世宗嘉靖四十三年）甲子年的事。

過了兩年，到嘉靖四十五年冬天，雲谷禪師悲憫禪宗將面臨滅絕的地步，就約集了五十三位同道，在「天界寺」結期坐禪，師全力鼓勵我參加共修，指示我參「向上一著」，並且先教我念佛數聲，再反觀這「念佛的人是誰」?到此時我才知道有禪宗這回事。而此時南京各佛教寺院，參禪的人不過四。五個罷了!

師漸漸老了，慈悲心愈為深切，雖然是七、八歲的小沙彌，也一律以慈悲的眼色看待他們，以恭敬心對待他們，凡是平時行住坐臥，沒有一樣不當面懇切地教導。耐心而有條理地指示他們;凡見到這種景象的人，人人都以雲谷禪師對自己特別親切，既然是他的護法心深切，不輕視初發心學佛的人，不怠慢破戒的比丘。........回最前

而當時有些出家人不能遵守戒律，凡是違犯了國家禁令的人，雲谷禪師一旦知道了，不等別人求救，他就自動去救助了，而且一定要懇求主管官吏，說佛法完全付託政府官吏為「外部護法」，祇希望他們能體悟佛陀的心意，對出家人的毀辱，便是對佛陀的毀辱了，聽到這席話的官吏們。

沒有不馬上改變了態度，直到把那些犯戒的人釋放為止。可是，這些事，外界竟然大多不知道，因此聽到這些話的人也不曾因為雲谷禪師的多事而感覺厭煩;時間久了，大家都知道他是出於非親非故，「與自己並無關係的大慈悲心」啊! ........回最前